南通大学是一所由原南通医学院、南通工学院、南通师范学院，于2004年合并组建的综合性大学。面对高等教育竞争激烈、发展迅速的形势，作为一所新组建的综合性大学，如何实现快速融合、深度融合，达到提升水平、和谐发展的境界，这是一个严峻而又现实的问题。教学质量是高等教育永恒的主题，是学校生存发展的生命线。南通大学以质量求内涵提升，改革谋和谐发展。学校组建伊始，就以创建有特色、高水平的本科教育为目标，确立了“以整合打基础，以发展求稳定，以改革带融合，以评估促提高”的工作思路，扎实有效地推进教育教学改革。为了抓住机遇，加快发展，深化改革，实现教学工作新跨越，从2006年起，学校组织实施了“人才培养模式改革”、“教师考核制度建设与青年教师培训”、“实践教学基地建设与实践教学改革”、“教材建设与管理体制改革”、“实验教学改革与平台建设”、“网络建设与多媒体教学改革工程”等六大教学改革工程，切实保证教学质量的提高。
一、人才培养模式改革工程
首先学校实行按学科大类招生，搭建通识课程平台和学科分类课程平台，构建“按照大类招生，强化学科基础，拓宽专业口径，实施分流培养”的人才培养模式。实行分流培养制度。低年级不分专业（淡化专业）；根据学科大类特点，分别在入学1年、1.5年和2年之后进行专业分流，确定选学专业或分流修读不同专业方向的课程；最后进行工作服务面向的分流。与分流制相配套，实行辅修制。根据社会需求和专业办学实际，面向全校开设若干辅修专业；学生自主选择修读，修完教学计划规定课程并获得规定学分的，由学校发给辅修证明。
其次全面实施文化素质教育，培养具有人文素养和科学精神、符合社会需要的人才。学校针对教育过程中普遍存在的“过窄的专业教育、过重的功利倾向和过弱的文化陶冶”等弊病，强化素质教育，构建涵盖社会科学、自然科学、中外文化、思维科学、历史研究、文学艺术、伦理道德、教育科学等方面的素质教育课程体系，开设社会科学概论、中外文化概论、自然科学概论、大学人文、创造学等素质教育课程，丰富学生的人文社会科学和自然科学知识，增进对其发展概况、基本理论和方法的了解，使学生在课内外学习和实践活动基础上，提升精神境界，培养健康的人格和高尚的情感，成为全面发展的具有正确世界观、人生观、价值观的社会主义现代化建设需要的创新型高级专门人才。
二、教师考核制度建设与青年教师培训工程
首先建立健全完善的教学质量监控体系。学校制定了南通大学教师教学工作规范，建立健全听课制度，全面实施学生评价教师制度，建立各级教学考核制度，形成优胜劣汰的聘用机制。建立教学奖励制度，通过教学成果奖、教学评优、教学名师评选等活动，创建优良教风。此外，实行师资校内流动制度。根据专业建设与发展的需要，合理配置师资，加强对教师的业务考核，凡经教育、帮助、整改，仍然达不到规定要求的，应调离教学岗位。同时，在其他岗位工作且学有专长的人员，符合教师任职条件的，可按照规定程序转入教师岗位。在教师职称评审中，明确并严格执行教师职务晋升中对教学研究论文的必备要求的规定，实行教学考核一票否决制，教学工作考核不合格者不得申请评聘高一级专业技术职务，同时每年年底教学考核成绩与津贴挂钩。这些制度的建设从根本上统一规范了思想，为教学工作的顺利开展提供了必要的保障。
其次加强对教师队伍的培训管理，提高教师的业务能力。学校加强对教师课程进修的管理和调控，设立专项经费确保课程进修。教师课程进修必须根据课程教学的需要选派，先由学院对教师其他形式的进修审批，必须首先确保教学工作正常、有序运行，最后由教务处扎口管理。在加强对教师课程进修的管理和调控的同时，重视对青年专项技能的培训。学校有组织、有计划地对全校青年教师进行教育教学理论、教师职业道德、教师教学规范、教学管理制度、课堂教学技能、双语教学、多媒体课件制作、教育教学研究和学术研究工作、学生思想政治工作等专项培训，全面提高青年教师的素质。
三、实践教学基地建设与实践教学改革工程
学校加大实践教学基地建设的力度，开展全方位合作，重点建设了附属医院、大型企业和主要实习学校等235个实践教学基地，尤其在师范类、医学类专业的实习基地稳定，找到了教学实践基地、社会实践基地、就业基地和优质生源基地一体化建设的有效途径，切实解决了医学专业异地教学的经费保障问题。在基地建设的基础上，学校改革专业实习管理模式，充分发挥教学实践基地的作用，正确处理好学业与就业的矛盾，提高毕业生的市场竞争能力。此外，学校还组织修订实践教学大纲和教学指导书，规范实践教学行为；重新制订师范专业教育实习、医学类专业实习改革方案，切实提高实践教学质量。
毕业设计（论文）是教学实践工作中的重要环节，学校着力抓好毕业设计（论文）的指导与管理工作，专门出台《南通大学全日制本科生毕业设计（论文）工作管理规程》，严格执行相关规章制度，对指导教师资格、论文选题、论文答辩严格把关，并且组织优秀毕业设计（论文）评选工作，切实提高毕业设计（论文）的质量。
四、教材建设与管理体制改革工程
学校启动教材建设项目，以保障本科教学需要为前提，保证足够的经费投入，鼓励教学经验丰富、在教学研究和学术研究方面有较高造诣的教师编写本科教材，积极参与国家“十一五”规划教材编写工作，鼓励开展校际合作。同时充分发挥学校教材工作委员会的作用，组织教材的审定、编写与评估工作。组织各级各类精品教材奖的评审、推荐工作。建立完善教材建设与管理制度，开发适应多校区和学分制管理要求的教材管理软件，提高教材管理工作的水平和效益。此外，学校还积极探索教材管理体制改革的有效途径，改革教材供应办法，建立新的教材选用制度。部分具备条件的学院正准备进行教材供应制度试点改革，实行教材准入制，由学校组织审定教材，研究论证，学生自行选择、购买。这种教材管理制度的改革，为如何整合校外资源、建立新的教材供应服务系统的可行性提供多种思路，进行有益的尝试。
五、实验教学改革与平台建设工程
2006年以来，学校按照教育教学改革以及专业建设、课程建设的总体要求，根据整体布局和多校区运行的实际，整合全校资源，组织制定实验教学改革与实验室建设总体发展规划，有目的、有计划地进行实验室建设。同时改革实验室管理模式与运行机制，高起点建设一批校级实验平台，实现优质资源共享，有效避免了分散配置、分散管理、局部使用、低水平重复的低效益建设等现象。
在改革过程中，科学地处理好实验教学与理论教学的关系，根据课程教学的目标、专业特点以及教学内容和课程体系改革的要求，大力推进实验室开放，通过更新、优化、重组，整合实验课程，强化综合性、设计性实验项目的设置和教学，培养学生的动手能力、思维能力和创新能力。
此外，学校根据现有专业建设与发展的实际需要，加大实验室建设经费投入力度。在原有工作的基础上，进行了学校实验室结构体系的调整和优化，完成了新建实验室、老实验室改造和特色专业实验室建设，在实验室数量、仪器设备的配备以及实验室建设经费等方面，达到现有本科专业办学的基本要求。并按照本科教学工作水平评估要求，确保经费投入按时足额到位。
六、网络建设与多媒体教学改革工程
学校投入大量资金加强网络建设，建立精品课程和网络教学平台，为校级精品课程网站的建设、运行与维护提供高质量的服务。同时通过引进国家精品课程、现有音像教材的数字化和网络化、教师自制教学课件上网、购置教学急需的电子音像教材等工作，加大网上教学资源建设力度。
学校积极开展教师现代教育技术培训和技术推广活动。经常举办精品课程建设培训班和青年教师教育技术培训班，通过培训，强化正确的多媒体教学意识，建立了一支具有现代教育理念，能充分掌握和科学利用多媒体技术进行教学研究的教师队伍。同时，建立多媒体课件评估准入制度，对在校内使用的多媒体课件进行审核、评估。另外还专门组织开展现代教育技术立项研究，提高教师教育技术应用水平。
通过认真学习教育部财政部《关于实施高等学校本科教学质量与教学改革工程的意见》和教育部《关于进一步深化本科教学改革全面提高教学质量的若干意见》的文件精神，经过一年多的实践，南通大学六大教学改革工程取得了丰硕成果。通过实施六大质量工程统一了教师和领导的思想认识，改变了在单科性、多科性院校背景中形成的思维定势，从旧观念和体制束缚中解放出来，以新的办学理念和目标凝聚人心，以改革促进融合，真正解决了合并过程中教学方面存在的矛盾和问题。通过实施六大质量工程，各教学环节逐步规范化、制度化，教学工作呈现出协调发展的基本态势，办学层次得到提升，教学质量得到提高。
在短短的两年多时间里，南通大学荣获了第九届“挑战杯”飞利浦全国大学生课外学术科技作品竞赛终审决赛三等奖两项。第五届“挑战杯”飞利浦中国大学生创业计划竞赛银奖两项，并同时荣获全国优秀组织奖 。2006年全国大学生数学建模比赛本科组一等奖一项、二等奖一项。2006年6月20日，江苏省教育厅举办的南通大学谭真同学事迹介绍会在南通大学新校区召开。同年底，和谭真一样，朱小兰同学又被评为江苏省十佳青年学生。2006年11月25日，南通大学2007届毕业生就业双选市场在校内举行。虽然连绵的阴雨使天气显得格外寒冷，但是这丝毫阻止不了用人单位参加双选市场的热情。前来的用人单位远远超过预计目标，达到538家。在就业形势严峻、竞争激烈的今天，由一所大学自行独立举办的就业双选市场，有如此火爆的情景，在国内高校当中实属罕见！南京市浦口区卫生局柯局长在接受记者采访的时候所说：“南通大学的毕业生专业基础扎实，素质好，肯吃苦，勤钻研。我们很欢迎南通大学的毕业生，所以我们今年又来南通大学招聘毕业生。”
